Llegada de los Saiyajins a la tierra
Después de cinco años sin ningún tipo de contratiempo, Goku se entrena en su nueva casa en la que está en compañía de su esposa, Chichi. Además, tuvo un hijo, al que llamó Son Gohan, como su abuelo. Un día, aparece un saiyajin, hermano de Goku, llamado Raditz. Este pretende eliminar a toda la humanidad. Este rapta al hijo de Goku. Goku, ayudado por Piccolo, siguen al malvado Raditz. Comienzan una batalla en la que Gohan demostrará su pdoer oculto. Al final, Goku consigue mantener a raya a Raditz, sujetándole por la espalda, mientras que Piccolo realiza un ataque, su Makankosappo, el cual atraviesa a Raditz, aunque también a Goku. Esto le costó la vida a Goku.
Antes de morir, Raditz avisa a sus compañeros Saiyajins, los cuales llegarán en un año a la tierra. Todos comienzan un entrenamiento muy duro para acabar con los compañeros de Raditz. Gohan es entrenado por Piccolo, mientras que los demás se entrenan en el templo de Dios. Incluso Goku se entrena en el otro mundo, donde van las personas que han muerto. Es entrenado por Kaioh. Le enseña muchas técnicas que Goku usará durante su aventura, entre ellas, el Kaioh Ken y el Genkidama.
Pasado ya el año, los Saiyajins llegan a la Tierra. Estos son Vegeta y Nappa. Tras una gran batalla, Chaoz, Ten Shi Han, Yamcha y Piccolo mueren. Goku es resucitado gracias a las Bolas de Dragón. Vegeta mata a Nappa, por pelear mal contra Goku, y el se enfrenta a este. Comienza una gran batalla entre Goku y Vegeta. En este gran combate, Vegeta se convierte en Ohzaru, pero la transformación es eliminada por Yajirobee, que le corta la cola a Vegeta. Al final todo acaba con la huida de Vegeta de la Tierra en su nave, malherido. Goku le perdona la vida para volver a enfrentarse con él.
Saga de Namek
Tras el combate contra los Saiyajins, Goku quiere revivir a sus amigos. Al morir Piccolo, Dios también murió, con lo que desaparecieron las Bolas de Dragón. Goku permanece recuperándose mientras que Bulma, Krillyn y Son Gohan se dirigen a Namek, un planeta en el que hay unas Bolas de Dragón más potentes que las de la Tierra. También se dirigen a por estas Vegeta y la tropa de Freezer...
En el planeta Namek, Gohan salva a un namekiano, llamado Dende, del que se hace amigo. Freezer consigue cinco Bolas de Dragón, mientras que Vegeta solo tiene una. Dende les cuenta que la última Bola se encuentra en la casa del Gran Saichoro, el cual les entrega la Bola de Dragón y aumenta el poder de Krillyn y de Gohan. Vegeta es cogido prisionero por Zarbon. Goku descubre los problemas de sus amigos y parte hacia Namek, entrenándose en la nave en la que se dirige. Freezer se da cuenta de que más gente quiere las Bolas de Dragón, por lo que llama a las Fuerzas especiales Ginew. Vegeta escapa y se encuentra de nuevo con Zarbon, pero esta vez, Vegeta lo elimina. Las Fuerzas Especiales encuentran a Vegeta. Goku aparece en ese momento y ayuda a Vegeta, eliminando a todos los miembros, excepto a Ginew, el cual intercambia su cuerpo con el de Goku. Goku, al final, consigue recuperar su cuerpo y que Ginew se quede en el de un sapo.
Vegeta lleva a Krillyn, Gohan y Goku a la nave de Freezer, para que descansen. Al día siguiente, Freezer consigue todas las Bolas de Dragón, e intenta invocar al Dragón, pero no puede porque necesita saber qué palabras pronunciar. Dende consigue invocarlo y resucitar a los amigos de Goku, con lo que las Bolas de Dragón vuelven a aparecer en la Tierra. Luego, piden que Piccolo vaya a Namek. Freezer se enfurece y se transforma muchas veces, cambiando su forma externa y poder, hasta que llega a su forma Perfecta. Asesina a Dende y deja muy mal a Vegeta, el cual muere un rato después. Goku se encuentra cara a cara con Freezer. Esta batalla es muy igualada, hasta que Freezer mata a Krillyn. Entonces, Goku se enfurece tanto, que se transforma en Super Saiyajin.
Freezer, al verse inferior que Goku, decide hacer explotar todo Namek. En la Tierra, se resucitan a los Namekianos, y a Krillyn. Al final, el Planeta explota, y parece que Goku ha muerto. Sus compañeros intentan resucitarlo, pero no pueden, ya que está vivo, pero el no quiere ir todavía a la Tierra.
Saga de los androides
Un año después de la batalla en Namek, nuestros amigos detectan una fuerza muy grande en la Tierra. Es Freezer, que ha vuelto en estado robótico, con su padre. Antes de que nuestros amigos lleguen, Freezer y su padre son derrotados por Trunks, un chico, hijo de Vegeta y Bulma, que viene del futuro. Este advierte a todos que la Tierra, en su futuro, está amenazada por unos androides, y que Goku está muerto, por una enfermedad del corazón. Este trae la medicina para que Goku no muera de la enfermedad. De repente, Goku aparece y enseña a todos su nueva técnica de teletransporte.
Trunks les dice que los androides aparecerán en tres años. Todos comienzan un duro entrenamiento. Pasado estos años, aparecen dos androides: A-19 yA-20 . Goku se enfrenta contra ellos (Yamcha muere) , pero cae enfermo, debido a que no tomó bien la medicina de Trunks. Vegeta se enfrenta contra ellos y se transforma en Super Saiyajin. Trunks les dice que esos no son los andriodes tan terribles que él decía, si no otros, los cuales aparecen un tiempo después: A-17, A-18 y A-16, los cuales matan a su creador, el Dr. Gero. Estos tienen varios enfrentamientos contra los guerreros Z. Pero la verdadera amenaza no son estos androides, si no Cell, un androide creado de las células de las guerreros Z. Este quiere alcanzar la perfección absorbiendo a los androides A-17 y A-18.
Saga de Cell
Este androide logra absorber a A-17, y procede a la búsqueda de A-18. Mientras tanto, Trunks y Vegeta acaban su entrenamiento en la Sala del Tiempo del Templo de Dios, mientras que Goku y Gohan lo comienzan. Goku quiere sacar a la luz el potencial oculto de Gohan. Vegeta y Trunks se enfrentan contra Cell. Vegeta es superiro a él, pero prefiere dejar que Cell alcance su forma perfecta. Al final, Cell lo consigue. Gohan consigue alcanzar el Super Saiyajin en la Sala del Tiempo. Cell, decepcionado, convoca un torneo, dentro de diez días, el "Cell Game".
Gohan y Goku salen de la sala del Tiempo y se entrenan de nuevo. El día del torneo, aparece un hombre llamado Mr. Satán, el cual es derrotado fácilmente por Cell. Goku se enfrenta a Cell, el cual destruye el ring para que nadie sea descalificado por tocar el suelo. Goku lucha contra él un rato, pero se da cuenta de su superioridad y decide que Gohan, ante la sorpresa de todos, ocupe su lugar. A-16, al verlo todo perdido, decide explotar y maatr a Cell, pero no sabía que Bulma le había quitado la bomba que llevaba dentro, por lo que no explota y Cell acaba con él. Cell envía a varios Cells pequeños para enfrentarse contra los querreros Z. Estos tienen problemas, y Gohan, enfurecido, libera el poder que Goku sabía que tenía, consiguiendo alcanzar el Super Saiyajin 2. Cell es ahora inferior a Gohan, incluso de un puñetazo consigue sacar a A-18 de Cell, por lo que se hincha y decide autodestruirse, aunque es parado por Goku, que se teletransporta con él al otro mundo, muriendo Goku y Kaioh.
Pero Cell no está muerto, vuelve a regenerarse y aparece más fuerte que nunca. Gohan realiza un Kame Hame Ha! muy potente, con una sola mano, y Cell también. Mantienen ambos chocando un rato, hasta que Goku habla con Gohan por el Toro Mundo y le ayuda, derrotando finalmente a Cell. Mr. Satan se autoproclama vencedor y todos los humanos le creen.
25º Torneo de Artes Marciales
Tras la derrota del malvado Cell, Son Gohan vive con su madre y su hermano pequeño Goten. Gohan ya va a la Universidad, que está en la ciudad de Mr. Satan. Gohan ve que esta ciudad tiene problemas, así que se disfraza con un traje que le ha hecho Bulma, y ayuda a los más desfavorecidos. Videl, una chica que estudia con él en su universidad, descubre su verdadera identidad y se une a él. Este le enseña sus mejores técnicas, entre ellas, volar. Ahora se dirigen hacia el torneo de Artes Marciales: Videl (con un nuevo corte de pelo), Son Gohan, Goten, Trunks, Vegeta, Piccolo, A-18 (se ha casado con Krillyn) , Krillyn y Goku, que ha tenido un día de permiso en la Tierra. Empieza el Torneo Infantil, que acaba con la victoria de Trunks sobre Goten. Trunks se llega a enfrentar contra Satán, el cual pierde, pero dice que le ha dejado ganar.
En el Torneo de alta categoría, hay cuatro integrantes extraños: Kibito, Kaioh Shin, Spopobich y Yamu. El Torneo se celebró con normalidad hasta que, cuando Gohan se iba a enfrentar contra Kibito, es atacado por Spopobich y Yamu, los cuales le roban la energía con un extraño aparato. Estos escapan y todos van tras de ellos. Durante la persecución, Kaioh Shin y Kibito les explican que esa energía la necesitaban para hacer reaparecer a un monstruo terrible: El Monstruo Boo, creado por un brujo llamado Bibidi. Su hijo, Babidi, quería revivirlo.
Saga de Buu
Nuestros amigos llegan a la nave de Babidi, el brujo. Allí se enfrentan contra sus secuaces, a los que derrotan tras unas pruebas. En una sala, Dabura, el secuaz principal de Babidi, se apodera de la mente de Vegeta, poniéndole una M en su frente, y aumentando su poder. Este reta a Goku y son transportados al estadio del torneo. Vegeta mata a multitud de personas y Goku se enfrenta contra él. Dabura se enfrenta contra Krillyn y Piccolo y los convierte en piedra. Gohan y Kaioh Shin van en busca del monstruo Buu, que se encuentra todavía en una bola gigante. Antes de que puedean evitarlo, Babidi resucita a Buu y este derrota a Son Gohan, mandándolo muy lejos, dándole todos por muerto. Después, convierte a Dabura en galleta y lo engulle. De esta forma, Piccolo y Krillyn vuelven a ser normales y se llevan a Goten y a Trunks al Templo de Dios. Goku y Vegeta siguen su enfrentamiento, cuando detectan la fuerza del monstruo. Vegeta engaña a Goku y lo deja KO, inconsciente. Vegeta se sacrifica con su técnica "Final Flash" , muriendo en vano, ya que el monstruo se regenera.
En el palacio de Dios, Goku propone a los chicos que realicen la "Fusión" (véase la sección "fusiones") . Estos entrenan esta técnica, y tras varios fallos, consiguen realizarla bien y se dirigen al encuentro de Buu, pero son derrotados. Goku se enfrenta contra Buu para entretenerle mientras Trunks busca el radar de las Bolas de Dragón. Goku alcanza el Super Saiyajin 3. Tras este encuentro, Goku debe volver al Otro Mundo, pero descubre la energía de Gohan y se dirige a su encuentro. Este se encuentra en la Tierra de los Dioses, lugar donde viven Kibito y Kaioh Shin. Alli saca una espada sagrada, que pesa mucho, y que se le rompe y de ella sale Roh Kaioh Shin, un Dios que se compromete a aumentar la fuerza de Gohan. En la Tierra, Buu asesina a Babidi y conoce a Mr. Satan y se hacen amigos. También tienen un perro, que es asesinado por unos asaltantes. También asesinan a Mr. Satan. Buu, enfurecido, resucita a Mr. Satan y al perro, mata a los tíos y, de repente, su parte mala hace aparición, la cual convierte a Buu en chocolatina y le engulle, "fusionándose" ambos y dando lugar a "Majin Buu".
Goten y Trunks, que ya saben realizar bien la fusión, retan a Buu. Este tiene que esperar a que estén listos, tiempo que emplea en matar a todos los humanos y a Chichi. Cuando están preparados, Piccolo va con Buu a la Sala del Tiempo. Allí, Goten y Trunks se fusionan, y comienza un gran duelo. La fusión se llama "Gotenks" , y es muy imaginativo, crea técnicas muy extrañas, como la de unos fantasmas que estallan al tocarlos. Es un duelo alocado, que acaba cuando Piccolo cree que todo está perdido y destruye la entrada a la Sala del Tiempo, quedando todos atrapados allí. Buu grita y abre un agujero en el espacio, por el que escapa. Gotenks consigue el Super Saiyajin 3 y también abre un agujero, por el que salen. Buu ya ha engullido a todos sus compañeros. Enfadados, siguen el duelo, y cuando están a punto de ganar, la fusión se deshace. Gohan consigue aumentar su fuerza, y va ala Tierra a enfrentarse contra Buu. Este se ve inferior, y absorbe a Gotenks y a Piccolo, haciéndose más fuerte. Goku, en el Planeta de los Dioses, obtiene de Roh Kaioh Shin los pendientes pottara, unos pendientes que unen para siempre a dos personas que se los pongan. Kibito y Kaioh Shin se fusionan en Kibito Shin. Goku va a la Tierra y le pide a Gohan fusionarse con él, el cual está en medio de un duelo con Buu-Gotenks. Gohan es antes absorbido por Buu. Aparece Vegeta, el cual a vuelto del otro mundo para ayudarles. Goku se fusiona con Vegeta y constituyen a Vegetto, el cual es muy superior a Buu. Este se introduce dentro de Buu, donde la fusión se deshace, debido al mal olor. Allí, liberan a sus compañeros absorbidos y escapan del interior de Buu. Buu consigue su forma perfecta, y destruye la Tierra. Goku y Vegeta son transportados al Planeta de los Dioses, donde se enfretan contra Buu, el cual los ha encontrado. Allí, piden a los Namekianos que reconstruyan la Tierra y reviva a sus habitantes con las Bolas de Dragón. Así lo hacen, y Goku realiza la técnica del Genkidama, que, con al ayuda de Mr. Satan logra que contribuyan todos los seres humanos. Goku lanza el Genkidama contra Buu y lo destruye por completo, pero antes, pide volver a enfrentarse contra él. Desde entonces, todos creen que Mr. Satan los salvó.
10 años después...
Diez años después, todo se entrenan para el Torneo que se va a disputar. Goku tiene una sobrina, Pan, la cual ha heredado la fuerza de su abuelo. El día del Torneo, todos lo tuvieron muy fácil. Allí, Goku buscaba a un chico que debía de ser la reencarnación de Buu. Los combates no eran nada igualados, y los guerreros Z los ganaban sin dificultad. A Goku le tocó contra una chico llamado Uub, al cual hizo enfadar para que desencadenara su poder oculto. Así fue, y Goku decidió llevárselo para comenzar un entrenamiento con él de varios años.